艾滋病患者抗病毒治疗存在一定耐药性。如果出现耐药，一般发生在治疗2-3年后。专家建议：更换治疗组合时多考虑选用含有增强作用的蛋白酶抑制剂，从而达到更好地病毒抑制效果。这是因为目前耐药基因突变主要是针对核苷类逆转录酶抑制剂或非核苷类逆转录酶抑制剂药物的，而对蛋白酶抑制剂的耐药在临床上尚比较少见。
专家提醒，对从未接触的抗病毒药物也已存在交叉耐药现象，应引起临床医生的高度关注，应加强耐药监测，及时调整用药，规范治疗和管理，节省有限的资源，防止耐药传播。
此研究报告刊登于《中华医学杂志》2010年第9期，题为“抗病毒治疗失败的艾滋病患者HIV-1基因型耐药变异的研究”，第一作者为深圳市第三人民医院感染疾病科医师王辉，此研究为国家“十一五”艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治科技重大专项及2008深圳市科技研发基金深港创新圈资助。
高效抗逆转录病毒治疗（HAART）是目前控制艾滋病感染的病程，降低患者病死率，延长生存期的有效办法。目前国内用来治疗艾滋病的药物主要有3类：核苷类逆转录酶抑制剂、非核苷类逆转录酶抑制剂及蛋白酶抑制剂。临床上通常采用联合用药的方法，包括两种核苷类逆转录酶抑制剂和一种非核苷类逆转录酶抑制剂或者一种蛋白酶抑制剂，但如果产生耐药，疗效就会明显下降，导致临床上抗病毒治疗失败。该研究团队探索艾滋病耐药情况，选择抗病毒治疗失败的艾滋病患者进行了抗病毒药物基因型耐药性的检测与研究，收集了2008年1月至2009年12月深圳市第三人民医院接受HAART治疗失败的41例艾滋病患者的血浆开展研究。
研究结果发现，艾滋病耐药变异株的出现是艾滋病患者临床上抗病毒治疗失败的主要原因，建议更换治疗组合时多考虑选用含有增强作用的蛋白酶抑制剂。
