芥末酱的发制和水解过程，是非常重要的工序，在此期间芥子苷在芥子酶的作用下，水解出异硫氰酸烯丙酯等辛辣物质，这是评价芥末酱质量优劣的关键。因此，必须严格控制发制条件，防止辛辣味挥发。
国产芥末籽有黑、黄、白3种，以黄色芥末籽水解后生成异硫氰酸烯丙酯的量最高。黄色芥末籽由于产地不同，又分浅黄色、大粒和深黄色、小粒2种。以选用浅黄色、大粒的芥末籽为好。
将芥末籽在37℃的水中浸泡30h，其目的是为了使分布在芥末籽细胞原体中的葡萄糖甘酶(芥子酶)激活，使种皮中的硫代葡萄糖苷在水解时充分水解，生成异硫氰酸烯丙酯一辛辣风味物。
芥末酱即能提取芥末中的辛辣素，异硫氰酸烯丙酯，又能保留芥末中的全部营养物，如蛋白质、维生素、微量元素等。芥末酱味辛性温，具有良好的益气化痰、温中开胃、发汗散寒、通络止痛等功效。其强烈的刺激性气味和清爽的味觉感受，能引起人们的食欲，是夏季凉拌菜最适宜的调料；同时，也可用其代替果酱涂抹面包，并在烹调时还可作调料使用。
