1、阴凉处储存：如果南瓜是完整的，还没有被切开，那么储存南瓜就容易多了，只需要将南瓜放置在阴凉处、通风口而且较为干燥的地方就可以将其保存很久。
2、冷藏冷冻储存：对于已经被切开的南瓜来说，可以先在南瓜切口表层覆盖一层保鲜膜，然后将裹有保鲜膜的南瓜放进冰箱的冷藏室里面进行保存。
3、堆藏：堆藏是把选好的南瓜直接堆放在室内。地面铺一层干草或麦秸，在上面堆放南瓜。摆放的方向要与生长时的状态相同，依次堆码成圆堆，每堆15-25个，高度5-6个瓜高为好。同时留出通道，以便检查。
4、窖藏：窖藏的南瓜选用主蔓上第二个瓜，根瓜不宜窖藏。采收时谨防损伤，禁止滚动、抛掷，否则内瓤震动受伤易导致腐烂。南瓜采收后在24℃-27℃下放置2周，使瓜皮硬化有利于贮藏，这对成熟度较差的瓜尤为重要。
5、架藏：仓库内用木、竹或角铁搭成分层贮藏架，铺上草包，将瓜堆放在架上，或用板条箱垫一层麦秸作为容器。南瓜放入后码成垛进行贮藏。这种方法透风散热效果比堆藏好，仓位容量也比堆藏大，观测、检查比较方便。
