自制饼干常温下不加干燥剂可以储存10~15天，如果保存时添加干燥剂则可保存一个月。
自己做的饼干和工厂的饼干是一样的，主要是保质方法问题。如果饼干做得好（不得含有水分），可以把烤好的饼干晾凉后放入保鲜袋或是干净的塑封袋中，挤出空气，用小夹子或是封口器密封好即可，或将晾凉的饼干放入密封袋中，排出空气，捏紧密封条。把饼干放置在干燥通风的地方，但是要避免阳光照射，温度保持在5～26度最佳，密封袋和保鲜袋能尽量延长保存的时间。
还可以选择把饼干放在冷藏中保存，这样可能会稍微影响曲奇的口感，但是可以保存得久一些，减少接触氧气的机会，不至于太快变质。在曲奇中，不同口感的其实保存的时间也是有区别的，曲奇饼干一般半个月之内就要赶紧吃完，但是黄油曲奇和抹茶曲奇之类的就可以放得久一些，一个月都可以。
