控制水量在正常孵化过程中，水流的控制一般采用慢一 快一慢的方式。在孵化缸中，卵刚人缸时水流只需能调节到将受 精卵翻动到水面中央处即可，这时大约20分钟能使全部水体更换一次。孵化环道中则以可见到卵冲至水面为准，即流速控制为 0.1米/秒，大约每30分钟可使水体更换一次。
胚胎出膜前后，必须加大水流量，这时孵化缸要增加到每15分钟便使全部水体更换 一次；孵化环道水流速提髙到0.2米/秒，大约每20分钟可使水体作一次交换。当全部孵出后，水流应适当减缓，并及时清除水中卵膜。当鳅苗能平游时水流应再减小，以免幼弱的鳅苗耗力过大。
泥鳅在繁殖过程中，受精卵的孵化是很重要的，其在室内或室外都可进行，有静水孵化和流水孵化。设备有孵化池、孵化网箱（可用集卵网箱）、孵化缸、孵化桶、孵化环道等，或就在产卵池内孵化。
在产卵池里放入亲鳅，当水温上升到18℃以上时，在池内放置已消毒的棕片、杨柳树根、水草等作为鱼巢。发现泥鳅产卵后，将已附卵的鱼巢转入孵化池，同时再放入新的鱼巢，待其再产卵。受精卵孵化对水质水温要求不高，一般养殖水体均可孵化，最适水温为20-28℃，大约2天左右时间仔鱼可以出膜。
